Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms