Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms