Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clptm1Q8VBZ3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms