Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a8Q8R4D1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms