Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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