Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms