Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnaaf4Q8R368 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms