Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cdc16Q8R349 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdc16Q8R349 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdc16Q8R349 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc16Q8R349 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdc16Q8R349 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdc16Q8R349 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdc16Q8R349 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdc16Q8R349 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdc16Q8R349 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms