Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms