Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms