Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf39Q8K2Z2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms