Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gtf3c1Q8K284 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gtf3c1Q8K284 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gtf3c1Q8K284 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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