Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacs1Q8K212 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms