Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh3Q8K1E6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh3Q8K1E6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms