Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms