Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnma3Q8JZW8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnma3Q8JZW8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms