Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne5Q8JZW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms