Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp10Q8CIE4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms