Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms