Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp2Q8CGR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms