Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28bQ8CEG5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28bQ8CEG5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms