Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc17Q8CE13 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms