Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms