Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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