Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8CC96 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8CC96 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8CC96 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8CC96 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms