Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf21bQ8C966 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf21bQ8C966 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Phf21bQ8C966 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf21bQ8C966 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms