Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms