Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms