Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms