Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms