Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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