Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms