Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms