Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms