Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rccd1Q8BTU7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms