Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup54Q8BTS4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms