Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms