Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf4Q8BH24 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf4Q8BH24 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms