Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms