Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms