Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms