Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms