Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms