Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necab1Q8BG18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms