Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT9

Svop, Synaptic vesicle 2-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvopQ8BFT9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvopQ8BFT9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SvopQ8BFT9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SvopQ8BFT9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms