Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms