Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms