Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms