Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnupnQ80W37 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnupnQ80W37 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms