Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms